Вечером 16 июля 1918 г. лица, назначенные Областным Советом к исполнению приговора над Романовыми, собрались в комнате коменданта в, доме особого назначения”. Комнаты верхнего этажа, где жила семья, были признаны неудобными для выполнения приговора. Решено было перевести семью вниз в одну из полуподвальных комнат и там привести приговор в исполнение до самого расстрела Романовы не знали о состоявшемся постановлении.
Около 12 ночи того же дня им было предложено одеться и сойти в нижние комнаты; чтобы не возбудить у них подозрения, было объяснено, что эта мера вызвана, якобы, предполагающимся в эту ночь нападением белогвардейцев на дом Ипатьева.
Когда все они были переведены в нижний этаж, в намеченную для исполнения приговора комнату, им было объявлено постановление Уральского областного Совета. После чего тут же все 11 человек: Николай Романов, его жена, сын, четыре дочери и четверо приближенных - были расстреляны. Ныне на месте расстрела возведен Храм «Во имя всех Святых в земле Российской просиявших» - Храм на Крови.
После расстрела трупы были перенесены в одеялах во двор дома и уложены в грузовой автомобиль. После чего - перевезены на "Ганину яму".
Ганина Яма - заброшенный рудник, расположенный в урочище «Четыре Брата» в 2,5 км к северу от посёлка Шувакиш и в 4 км на юго-восток от деревни Коптяки возле г. Екатеринбурга. В середине XIX века этот участок земли купил подрядчик по имени Гавриил в надежде отыскать здесь золото. Жители деревни Коптяки называли владельца рудника Ганей. Отсюда и пошло название самой большой разработки рудника — Ганиной Ямы. Золото здесь не нашли, зато добывали железную руду. К началу XX века рудник был заброшен, шахты обвалились и поросли лесом.
В ночь с 16 на 17 июля 1918 года на это место после расстрела были вывезены и сброшены в шахту останки императора Николая Второго, его семьи и приближенных. 18 июля 1918 г. днем с "похоронами" было закончено и настолько основательно, что впоследствии белые, в течение двух лет производя специальные раскопки в этом районе, не могли найти могилы Романовых. О расстреле Романовых в Екатеринбурге официально было опубликовано 22 июля. Накануне об этом было сделано сообщение на рабочем митинге в городском театре, встреченное бурным выражением восторга.
29 июля 2007 г. в длящихся почти девяносто лет поисках останков царской семьи, убитой в Ипатьевском доме, произошло знаменательное событие. Участник поисковой группы, член Екатеринбургского военно-исторического клуба «Горный щит» Л.Г. Вохмяков обнаружил на Старой Коптяковской дороге, метрах в семидесяти от Мемориала Романовых, большое кострище. В разведочном шурфе были выявлены костные останки, фрагмент керамического сосуда, кусок тёмной ткани. Немедленно сформированная комплексная археологическая экспедиция заложила раскоп и стала вести научно-исследовательские работы. На основании предварительных архивных исследований можно было сделать выводы и предположить, что на Старой Коптяковской дороге, недалеко от места находки в 1991 г. останков царской семьи, найдено место сокрытия отсутствующих в первом захоронении тел членов императорской фамилии – цесаревича Алексея и великой княжны Марии.
Ныне на Ганиной Яме расположен мужской монастырь в честь Святых Царственных Страстотерпцев. Первый камень монастыря заложен 1 октября 2000 года, сейчас на этом месте действует семь храмов — по количеству убитых членов царской семьи.